这时袁世凯手下的亲信官僚也认为袁世凯一旦称帝，大内三海即为新皇宫苑，住着黎元洪这样一个民国的元勋实在不伦不类，有碍观瞻，建议袁批准黎的请求。所以黎的这一要求得到允许。袁世凯以10万元购得北京东城东厂胡同一处大宅，赠给黎元洪，以图示恩结好。黎元洪遂在9月下旬举家迁入。
此后，他即在东厂胡同宅中“闭户养疴”，谢绝宾客。对帝制一事不发一言。当10月底袁世凯一手导演的国体投票结束，国体变更已成定局时，黎元洪再次咨文参政院，提出辞去副总统、参政院长、总参谋长三项职务，宣布从11月份起不再领取副总统的薪俸与公费，请袁世凯下令裁撤副总统办公处，遣散卫兵连。
这时，因帝制问题，进步党要人梁启超等也已与袁分道扬镳，黎与进步党人相近，知道进步党人正在酝酿反袁，袁的帝制短期内必然失败。为个人的利害而计，也没有必要为洪宪王朝作无谓的牺牲。况且自己为共和元勋，追随帝制也为国人所不齿。